Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Etfrf1-205ENSMUST00000111724 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Cstf2-203ENSMUST00000113287 3661 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ins2-205ENSMUST00000105933 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ins2-206ENSMUST00000105934 480 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gnb2-209ENSMUST00000143495 1285 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Atp6v1f-203ENSMUST00000149646 806 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm6745-201ENSMUST00000199216 526 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Gm19220-201ENSMUST00000222682 803 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Tmem219-201ENSMUST00000032926 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Hilpda-201ENSMUST00000054445 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
MyripQ8K3I4 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Car7-202ENSMUST00000159416 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Zic4-209ENSMUST00000173933 1764 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Id1-202ENSMUST00000109824 1160 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Prcd-202ENSMUST00000116318 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Tac2-202ENSMUST00000179960 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Poc1a-205ENSMUST00000191434 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Tac2-201ENSMUST00000026466 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Smim11-201ENSMUST00000063641 517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Eapp-201ENSMUST00000067272 590 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Psrc1-202ENSMUST00000102629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Syt8-201ENSMUST00000097939 1300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Cnmd-201ENSMUST00000022603 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Wisp3-201ENSMUST00000076713 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
MyripQ8K3I4 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms