Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

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Length 649 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Cpne1-201ENSMUST00000079312 1683 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Hcrt-201ENSMUST00000055083 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 D230025D16Rik-201ENSMUST00000034361 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Arpin-201ENSMUST00000048731 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Olfml2a-201ENSMUST00000057279 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Ilvbl-212ENSMUST00000220430 2350 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Nup62-205ENSMUST00000208626 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Nup62-201ENSMUST00000057195 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Slc4a1-201ENSMUST00000006749 4545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Gm26688-201ENSMUST00000181176 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Luc7l-203ENSMUST00000119928 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Hid1-201ENSMUST00000044152 3236 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Tpr-203ENSMUST00000124973 7430 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Gm45277-201ENSMUST00000210549 1695 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Gm16090-201ENSMUST00000130296 1704 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Dis3l-203ENSMUST00000120760 3661 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Pigg-203ENSMUST00000119014 4573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 AC164565.1-201ENSMUST00000217520 1484 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Trappc12-201ENSMUST00000020954 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Gm15427-201ENSMUST00000117288 531 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Rpl18-ps1-201ENSMUST00000121555 525 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
Ssh3Q8K330 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
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