Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2M3

Srrd, SRR1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrdQ8K2M3 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Fam103a1-201ENSMUST00000042166 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 E130317F20Rik-202ENSMUST00000217802 3420 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Tmem199-201ENSMUST00000052566 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Rxrg-202ENSMUST00000111380 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Myef2-207ENSMUST00000147105 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Cd34-202ENSMUST00000110815 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Pnrc2-201ENSMUST00000030436 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm15487-201ENSMUST00000122373 465 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Unkl-205ENSMUST00000161679 1053 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm5819-201ENSMUST00000171469 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm27533-201ENSMUST00000183800 152 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm43691-201ENSMUST00000196625 697 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Bhlhb9-204ENSMUST00000180025 2812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Matn2-206ENSMUST00000228570 2798 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Map7d1-202ENSMUST00000106132 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Fbxw4-204ENSMUST00000160018 931 ntTSL 3 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Tnfrsf12a-202ENSMUST00000167059 858 ntTSL 2 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm26839-201ENSMUST00000180686 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Tnfrsf12a-201ENSMUST00000024698 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
SrrdQ8K2M3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 BC026585-201ENSMUST00000046743 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Ubqln2-201ENSMUST00000060714 3344 ntAPPRIS P1 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Trib1-201ENSMUST00000067543 4330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
SrrdQ8K2M3 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms