Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2L8

Trappc12, Trafficking protein particle complex subunit 12, mousemouse

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Length 797 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc12Q8K2L8 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 AC174678.1-201ENSMUST00000228007 2749 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Aire-207ENSMUST00000140636 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Chd3os-203ENSMUST00000218008 1026 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Cracr2a-201ENSMUST00000071563 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Trappc12Q8K2L8 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
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Trappc12Q8K2L8 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
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Trappc12Q8K2L8 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Trappc12Q8K2L8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Trappc12Q8K2L8 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Mvk-202ENSMUST00000112239 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
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Trappc12Q8K2L8 Gm37015-201ENSMUST00000192763 1521 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Dhrs3-207ENSMUST00000171001 1349 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
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Trappc12Q8K2L8 Isg20-202ENSMUST00000118867 697 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 A330102I10Rik-202ENSMUST00000140415 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Naa60-209ENSMUST00000175809 279 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Trappc12Q8K2L8 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms