Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Mtmr3Q8K296 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Mtmr3Q8K296 Id2-202ENSMUST00000221761 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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Mtmr3Q8K296 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Mtmr3Q8K296 Snx22-201ENSMUST00000044711 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Mtmr3Q8K296 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Mtmr3Q8K296 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
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Mtmr3Q8K296 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Ctps-201ENSMUST00000030381 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
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Mtmr3Q8K296 Pip5k1c-210ENSMUST00000163075 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Stip1-201ENSMUST00000025918 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Prr18-201ENSMUST00000069742 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Gm26546-201ENSMUST00000181000 4276 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Pde4a-202ENSMUST00000039413 4653 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Pou2f2-209ENSMUST00000175774 7047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Prkcb-202ENSMUST00000064989 2911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Mtmr3Q8K296 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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