Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 8430429K09Rik-204ENSMUST00000146456 1675 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Lrrc8d-201ENSMUST00000060531 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Mcur1-201ENSMUST00000021800 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Amotl2-201ENSMUST00000035121 4328 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Armc8-201ENSMUST00000035043 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Pigg-201ENSMUST00000031189 3427 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Lzts1-201ENSMUST00000037049 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Wdr13-205ENSMUST00000130832 4374 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Cdk19-202ENSMUST00000095743 3973 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm45630-201ENSMUST00000210243 1911 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Ret-201ENSMUST00000032201 5456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Dhx29-201ENSMUST00000038574 4682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Dido1-207ENSMUST00000130986 4898 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Stt3b-201ENSMUST00000035010 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Mapk7-202ENSMUST00000101085 3254 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Lrrc14-210ENSMUST00000155735 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Park7-204ENSMUST00000105675 882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Irs3-202ENSMUST00000196511 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Bptf-203ENSMUST00000106763 12036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm42471-201ENSMUST00000201457 1865 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gnpda2-201ENSMUST00000031117 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 2010300F17Rik-202ENSMUST00000181758 2493 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Me2-201ENSMUST00000025439 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Eif5b-201ENSMUST00000027252 7797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm42878-202ENSMUST00000200170 4783 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Eif3j1-201ENSMUST00000028668 5413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Klhl32-204ENSMUST00000108218 7143 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Pgr-201ENSMUST00000070463 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Pgr-202ENSMUST00000098986 3068 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Prx-203ENSMUST00000108355 5433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Rasa4-202ENSMUST00000100570 2660 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Tacc3-201ENSMUST00000074849 2669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Kcnh2-201ENSMUST00000036092 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Rnf152-202ENSMUST00000172299 8406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Smarca4-204ENSMUST00000174008 5405 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Znhit1-204ENSMUST00000111091 1070 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Cldn34c1Q8K193 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms