Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIT9

Sbsn, Suprabasin, mousemouse

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Length 700 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SbsnQ8CIT9 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm2115-201ENSMUST00000180387 7055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Emilin2-201ENSMUST00000024849 3910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Phka1-206ENSMUST00000122022 6115 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Phka1-202ENSMUST00000052012 6115 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Srr-204ENSMUST00000121738 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ahcyl2-205ENSMUST00000125911 2039 ntTSL 5 BASIC12.1□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Dcp1b-202ENSMUST00000112777 3313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Nub1-202ENSMUST00000197407 3546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Zfp57-202ENSMUST00000089968 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Zfp318-204ENSMUST00000138127 3936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Sema4b-201ENSMUST00000032754 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Tgm1-203ENSMUST00000178034 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ddx39b-202ENSMUST00000172549 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Srp72-202ENSMUST00000120550 2297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 4933416C03Rik-201ENSMUST00000099261 2254 ntAPPRIS P1 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Nol4-208ENSMUST00000164893 2175 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ephb3-201ENSMUST00000006112 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Il17rd-203ENSMUST00000225146 3366 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
SbsnQ8CIT9 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Spg7-202ENSMUST00000125975 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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SbsnQ8CIT9 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Dnajc6-204ENSMUST00000106930 5127 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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SbsnQ8CIT9 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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SbsnQ8CIT9 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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SbsnQ8CIT9 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
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SbsnQ8CIT9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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SbsnQ8CIT9 Ldlrad3-201ENSMUST00000058790 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm43061-201ENSMUST00000198850 2241 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 F2-202ENSMUST00000111335 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Slc4a5-201ENSMUST00000039212 5123 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm26867-201ENSMUST00000180963 3615 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Evl-203ENSMUST00000109854 1870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Gm42480-201ENSMUST00000198434 2595 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 P4hb-201ENSMUST00000026122 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
SbsnQ8CIT9 Tacc3-202ENSMUST00000079534 2899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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