Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHP6

Phc3, Polyhomeotic-like protein 3, mousemouse

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Length 981 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phc3Q8CHP6 Gabpb1-205ENSMUST00000110424 2613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Cbl-206ENSMUST00000206147 3452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Exd2-201ENSMUST00000038185 3310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Olfr533-203ENSMUST00000215308 2345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Desi1-206ENSMUST00000152227 2934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Zfp574-202ENSMUST00000179556 4140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Arhgef1-202ENSMUST00000098683 3375 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Slc22a20-201ENSMUST00000041827 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm2155-201ENSMUST00000181581 1974 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Slc52a3-202ENSMUST00000109858 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Scg2-201ENSMUST00000049972 2515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 St13-205ENSMUST00000172107 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Kif3c-205ENSMUST00000220210 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm13344-201ENSMUST00000137714 1557 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Pde4a-203ENSMUST00000115458 2962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Ttll5-203ENSMUST00000095536 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Arl4a-205ENSMUST00000146905 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Ddx23-201ENSMUST00000003450 3187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Prkg1-206ENSMUST00000182685 1628 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Chrnd-202ENSMUST00000186373 2949 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Ap2m1-201ENSMUST00000007216 2937 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Sox17-206ENSMUST00000192650 3242 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Hspb7-201ENSMUST00000102486 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Nosip-202ENSMUST00000107829 972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Eps8l1-214ENSMUST00000171445 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Lyzl6-201ENSMUST00000021328 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Irak2-202ENSMUST00000089022 2974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Gm15889-202ENSMUST00000212669 2443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Kcnh7-202ENSMUST00000112452 2849 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Phc3Q8CHP6 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms