Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH72

Trim32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim32Q8CH72 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Dnajc5g-201ENSMUST00000066544 1565 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 4933415J04Rik-201ENSMUST00000195895 1301 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Gm21470-201ENSMUST00000187680 696 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 1700094J05Rik-202ENSMUST00000190491 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Naa10-201ENSMUST00000033763 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Hoxc10-201ENSMUST00000001699 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Dnm1l-203ENSMUST00000115749 4068 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Dnm1l-202ENSMUST00000096229 4056 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 B3gnt8-201ENSMUST00000076034 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Pdpn-202ENSMUST00000119654 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Tbx3os1-203ENSMUST00000140101 490 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 4930456L15Rik-201ENSMUST00000145577 1185 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Gm20753-201ENSMUST00000190105 545 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Gm45841-201ENSMUST00000207700 164 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Trim32Q8CH72 Tmem255a-203ENSMUST00000089056 1745 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Gm9252-201ENSMUST00000172364 1602 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trim32Q8CH72 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trim32Q8CH72 Ndufa13-201ENSMUST00000110167 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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Trim32Q8CH72 Efcab10-201ENSMUST00000020878 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Tead4-201ENSMUST00000006311 3076 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Gm6297-201ENSMUST00000181475 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Ice2-203ENSMUST00000117610 800 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Gm13392-201ENSMUST00000117708 150 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Smim5-201ENSMUST00000131566 700 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 Gm11592-201ENSMUST00000133160 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trim32Q8CH72 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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