Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGR7

Upp2, Uridine phosphorylase 2, mousemouse

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Length 320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upp2Q8CGR7 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm11425-201ENSMUST00000119608 498 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Rapgef3os2-201ENSMUST00000124374 920 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Rpl12-203ENSMUST00000126610 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 1700001C02Rik-203ENSMUST00000127815 660 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 2810429I04Rik-210ENSMUST00000189464 868 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Tppp3-203ENSMUST00000177126 1396 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Sema4c-203ENSMUST00000191677 3779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm14452-201ENSMUST00000118680 1632 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Mir692-1-201ENSMUST00000102263 109 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm30437-201ENSMUST00000206086 1201 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm5356-201ENSMUST00000093326 615 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gapdh-203ENSMUST00000118875 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm5279-201ENSMUST00000199575 745 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm6007-201ENSMUST00000208170 823 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Kcnk9-201ENSMUST00000044624 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Lce3a-201ENSMUST00000067318 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Gbp5-201ENSMUST00000090127 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Snrpa-202ENSMUST00000122202 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Adm-201ENSMUST00000033054 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Ldhal6b-201ENSMUST00000189788 1445 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Rsrp1-201ENSMUST00000078084 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Bbs10-201ENSMUST00000040454 2744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
Upp2Q8CGR7 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Upp2Q8CGR7 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms