Protein–RNA interactions for Protein: Q8CFC7

Clasrp, CLK4-associating serine/arginine rich protein, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ClasrpQ8CFC7 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Exoc3l-201ENSMUST00000057855 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Sec61a2-209ENSMUST00000193792 2110 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gps1-208ENSMUST00000208737 1843 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Sem1-201ENSMUST00000041111 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Tmem131l-202ENSMUST00000191758 5555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Il11ra1-201ENSMUST00000098132 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Caprin1-201ENSMUST00000028607 6169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Fam189b-202ENSMUST00000117278 2593 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Hnrnpa2b1-210ENSMUST00000204188 1518 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Elk4-201ENSMUST00000027696 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Selenon-201ENSMUST00000060435 3445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Brd2-201ENSMUST00000025193 4374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Mapk8-201ENSMUST00000022504 2587 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Med15-201ENSMUST00000012259 3383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Arid5a-201ENSMUST00000097778 2270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm17251-201ENSMUST00000170103 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Miip-201ENSMUST00000030886 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Crybg2-213ENSMUST00000227683 5578 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Cyp20a1-201ENSMUST00000060608 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Pprc1-202ENSMUST00000099392 3956 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ClasrpQ8CFC7 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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