Protein–RNA interactions for Protein: Q8CE33

Klhl11, Kelch-like protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klhl11Q8CE33 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Fam151a-201ENSMUST00000047620 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Arhgap10-201ENSMUST00000076316 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm15199-201ENSMUST00000129933 542 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Tmem262-201ENSMUST00000143303 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm6159-201ENSMUST00000191249 1724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Myef2-206ENSMUST00000142718 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Tmc8-202ENSMUST00000106334 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Slc35a2-202ENSMUST00000115660 3094 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Elk3-201ENSMUST00000008542 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Ppil3-203ENSMUST00000114348 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Tbc1d10c-201ENSMUST00000045864 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Kcnj8-202ENSMUST00000203945 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Srcin1-202ENSMUST00000107593 3733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm27177-203ENSMUST00000184034 1911 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Bid-201ENSMUST00000004560 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Stra8-203ENSMUST00000114999 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Sema3b-201ENSMUST00000073448 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Pcdha12-201ENSMUST00000047614 5335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm7336-201ENSMUST00000107041 1232 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Klk5-201ENSMUST00000048444 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Klhl11Q8CE33 Olfr1411-202ENSMUST00000190844 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms