Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDI2

Fbxo43, F-box only protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo43Q8CDI2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Exosc5-206ENSMUST00000206561 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm45667-201ENSMUST00000210380 1316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Trim15-201ENSMUST00000025329 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Brsk2-204ENSMUST00000105989 2149 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm20036-201ENSMUST00000177547 844 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Tmub2-205ENSMUST00000156326 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Jakmip1-201ENSMUST00000043794 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Palm-201ENSMUST00000046945 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Ctu2-201ENSMUST00000116412 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Sipa1-204ENSMUST00000169854 3583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 A230077H06Rik-201ENSMUST00000188579 2918 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Chst4-202ENSMUST00000211894 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm2895-201ENSMUST00000171591 3194 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Sohlh2-201ENSMUST00000029369 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Rbbp7-201ENSMUST00000033720 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Paf1-201ENSMUST00000003529 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Crybb3-204ENSMUST00000119627 828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Mir1897-201ENSMUST00000122581 272 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Selenow-201ENSMUST00000044355 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Sirt3-202ENSMUST00000106048 1416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Sirt5-207ENSMUST00000221515 1793 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Papd7-201ENSMUST00000044081 3994 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Ubiad1-201ENSMUST00000051633 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Clcnkb-202ENSMUST00000105788 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm15384-201ENSMUST00000138832 486 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm25144-201ENSMUST00000179561 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm25352-201ENSMUST00000179815 110 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm27430-201ENSMUST00000184585 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Fbxo43Q8CDI2 Gm44333-201ENSMUST00000197168 107 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms