Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rnpc3-202ENSMUST00000106535 2616 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.06□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Egr3-204ENSMUST00000225200 3940 ntAPPRIS P2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ppp2r5c-201ENSMUST00000084985 1847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rbbp5-206ENSMUST00000190825 2456 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Slc4a1ap-213ENSMUST00000202950 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Erc1-207ENSMUST00000183911 3865 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Fam83e-201ENSMUST00000129507 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 AI467606-201ENSMUST00000056288 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Egfl7-202ENSMUST00000102907 1372 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Adprhl1-201ENSMUST00000033825 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.05□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne6-202ENSMUST00000163767 2004 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 1810030O07Rik-201ENSMUST00000060108 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ccp110-202ENSMUST00000106557 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Hgs-202ENSMUST00000106203 2901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Oprl1-203ENSMUST00000108766 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm37230-201ENSMUST00000194491 818 ntBASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Dmrt1-202ENSMUST00000087525 1130 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm26565-201ENSMUST00000181642 1968 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Angel2-202ENSMUST00000066632 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf114-201ENSMUST00000078050 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Pgghg-204ENSMUST00000164580 3001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Nxpe5-202ENSMUST00000159798 2568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Rasd2-202ENSMUST00000139848 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Nop9-201ENSMUST00000019441 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.04□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 March8-213ENSMUST00000203193 4245 ntTSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12626-201ENSMUST00000117339 1983 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Gm12623-201ENSMUST00000119849 1983 ntBASIC12.03□□□□□ -0.48
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf4-253ENSMUST00000202610 1959 ntTSL 5 BASIC12.03□□□□□ -0.48
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