Protein–RNA interactions for Protein: Q8C2B3

Hdac7, Histone deacetylase 7, mousemouse

Predictions only

Length 938 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac7Q8C2B3 4930573H18Rik-201ENSMUST00000197696 906 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Fam76a-201ENSMUST00000030696 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm28496-202ENSMUST00000137742 2752 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm43056-201ENSMUST00000197865 2791 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm42893-201ENSMUST00000198035 1502 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Slc25a19-201ENSMUST00000021089 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Slc9a3-201ENSMUST00000036208 2490 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm4081-201ENSMUST00000195287 1838 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Wdr38-202ENSMUST00000112872 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 5830408C22Rik-201ENSMUST00000210072 1115 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm5771-201ENSMUST00000049079 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Psap-202ENSMUST00000105465 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm26882-201ENSMUST00000181611 1537 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 A530083I20Rik-203ENSMUST00000214426 1855 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Hdac7Q8C2B3 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Fam57b-203ENSMUST00000205324 1915 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Ppp1r15a-202ENSMUST00000167273 2809 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac7Q8C2B3 Grid2ip-202ENSMUST00000110733 3825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac7Q8C2B3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Iqcf3-201ENSMUST00000062917 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Hdac7Q8C2B3 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Npnt-204ENSMUST00000117164 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Jph3-201ENSMUST00000026357 3637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Fam19a4-201ENSMUST00000089295 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Trp53bp2-201ENSMUST00000117245 4361 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Syt13-201ENSMUST00000028648 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm13517-201ENSMUST00000120782 1495 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 N4bp3-201ENSMUST00000001080 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Cyp27a1-201ENSMUST00000027356 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Hdac7Q8C2B3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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