Protein–RNA interactions for Protein: Q8C263

Ska3, Spindle and kinetochore-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ska3Q8C263 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Slc27a1-201ENSMUST00000034267 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Phldb1-212ENSMUST00000138356 5600 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Sept1-201ENSMUST00000106313 1285 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Spo11-201ENSMUST00000050442 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Mtif2-202ENSMUST00000093239 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Ssty1-201ENSMUST00000180056 699 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm29310-201ENSMUST00000185468 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21825-201ENSMUST00000185728 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm29109-201ENSMUST00000185895 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21896-201ENSMUST00000186520 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21873-201ENSMUST00000186728 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21794-201ENSMUST00000187056 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21880-201ENSMUST00000187275 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21826-201ENSMUST00000187451 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21198-201ENSMUST00000188393 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21749-201ENSMUST00000189343 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21901-201ENSMUST00000189568 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm29424-201ENSMUST00000189716 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm28599-201ENSMUST00000189838 694 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21867-201ENSMUST00000189917 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm29269-201ENSMUST00000190087 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21722-201ENSMUST00000190153 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm28423-201ENSMUST00000190701 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21899-201ENSMUST00000190745 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21910-201ENSMUST00000191163 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21849-201ENSMUST00000191571 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm28678-201ENSMUST00000191593 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm20910-201ENSMUST00000193268 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm21871-201ENSMUST00000194621 696 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Catip-201ENSMUST00000097697 2101 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm44981-201ENSMUST00000205549 1943 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Itsn1-202ENSMUST00000064797 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Ism2-202ENSMUST00000125733 2526 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Insr-201ENSMUST00000091291 9355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Os9-201ENSMUST00000080975 2458 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Kif21b-201ENSMUST00000075164 9115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Tmc8-201ENSMUST00000050874 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Ap2a1-202ENSMUST00000107857 3301 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Myl12a-206ENSMUST00000148960 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Krt20-201ENSMUST00000017743 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm19863-201ENSMUST00000192480 2218 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Pls1-201ENSMUST00000093800 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Kcnip1-202ENSMUST00000101368 2322 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm13823-201ENSMUST00000119930 345 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ska3Q8C263 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
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