Protein–RNA interactions for Protein: Q8C0C4

Ccser1, Serine-rich coiled-coil domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 895 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccser1Q8C0C4 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Rassf10-201ENSMUST00000182858 3496 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Mapt-203ENSMUST00000106989 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Slc43a1-203ENSMUST00000111625 2487 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Usp35-201ENSMUST00000139582 4262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Apoo-203ENSMUST00000113897 1218 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm14719-201ENSMUST00000121891 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm5626-201ENSMUST00000222151 1058 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Spsb2-201ENSMUST00000047760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Atp6v1h-204ENSMUST00000192698 1811 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Chp2-201ENSMUST00000033152 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ldoc1-201ENSMUST00000075983 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm12522-201ENSMUST00000142833 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gata2-201ENSMUST00000015197 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ccnh-204ENSMUST00000164127 1718 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Uvrag-201ENSMUST00000037968 5157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Slc43a1-201ENSMUST00000028469 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Slc8b1-203ENSMUST00000111889 1624 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Mapk9-210ENSMUST00000178543 4677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Aqp11-205ENSMUST00000206389 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 9930104L06Rik-201ENSMUST00000094769 2911 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 4930417O22Rik-201ENSMUST00000123249 1184 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Nabp1-202ENSMUST00000185534 708 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm37267-201ENSMUST00000194222 681 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 AC132863.2-201ENSMUST00000226643 799 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Mlf1-202ENSMUST00000077916 1114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Zbtb7b-204ENSMUST00000107435 4333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Neu2-203ENSMUST00000164128 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Zfp57-201ENSMUST00000069250 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Rxra-203ENSMUST00000113934 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Pld3-201ENSMUST00000117095 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Acr-201ENSMUST00000023295 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Rph3al-203ENSMUST00000108420 695 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm33320-201ENSMUST00000192232 530 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Cela1-201ENSMUST00000023775 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ccser1Q8C0C4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
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