Protein–RNA interactions for Protein: Q8C006

Trim35, Tripartite motif-containing protein 35, mousemouse

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Length 501 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim35Q8C006 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 AC163651.2-202ENSMUST00000222628 1192 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Arhgdib-201ENSMUST00000032344 1193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Grin1os-201ENSMUST00000129723 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Homer1-209ENSMUST00000109496 772 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Homer1-211ENSMUST00000109498 815 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Lipo4-201ENSMUST00000112511 1188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Cd47-202ENSMUST00000114496 867 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm13118-201ENSMUST00000120402 549 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm12706-201ENSMUST00000121588 698 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm12637-201ENSMUST00000130501 368 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm15839-201ENSMUST00000138684 612 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm8356-202ENSMUST00000164917 984 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm8705-201ENSMUST00000180823 812 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 Gm7344-201ENSMUST00000212122 1222 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Vmn1r33-201ENSMUST00000079678 1036 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Camk2b-209ENSMUST00000109813 4023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Camk2b-204ENSMUST00000090443 4004 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Spock1-203ENSMUST00000185905 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm7647-201ENSMUST00000200996 1389 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Klhl26-202ENSMUST00000166976 2734 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 Serpina3a-202ENSMUST00000109965 1204 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm25317-201ENSMUST00000116824 129 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm15929-201ENSMUST00000138926 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
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Trim35Q8C006 Gm10660-201ENSMUST00000148610 1203 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm26706-201ENSMUST00000180718 746 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Trim35Q8C006 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59 ms