Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSD4

Gjd4, Gap junction delta-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjd4Q8BSD4 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gm13786-201ENSMUST00000122371 333 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gm16505-201ENSMUST00000179981 232 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Rfxank-203ENSMUST00000212320 1121 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Fuom-201ENSMUST00000026539 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Abhd3-202ENSMUST00000117726 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gm8706-201ENSMUST00000197372 1491 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gm9742-201ENSMUST00000165220 1553 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gm10369-201ENSMUST00000100641 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gm13369-201ENSMUST00000119442 987 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Drap1-209ENSMUST00000136579 734 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gm6621-201ENSMUST00000193251 772 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 AC154462.2-201ENSMUST00000227519 370 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Cenpm-202ENSMUST00000089157 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Pnck-203ENSMUST00000114473 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Spo11-202ENSMUST00000109125 1591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gjd4Q8BSD4 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Platr29-201ENSMUST00000130022 830 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Gm40493-201ENSMUST00000210223 400 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Ptx4-201ENSMUST00000054930 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Pdpn-201ENSMUST00000030317 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Psmd13-208ENSMUST00000163610 1382 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Gm5687-201ENSMUST00000118252 640 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gjd4Q8BSD4 Gm12714-201ENSMUST00000143391 669 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms