Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJQ2

Usp1, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 1, mousemouse

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Length 784 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp1Q8BJQ2 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp1Q8BJQ2 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Cdca5-201ENSMUST00000025704 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
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Usp1Q8BJQ2 Lmf1-201ENSMUST00000063344 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp1Q8BJQ2 Islr2-204ENSMUST00000165276 3989 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp1Q8BJQ2 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Dot1l-201ENSMUST00000105336 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Usp1Q8BJQ2 Ints3-203ENSMUST00000196530 3778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp1Q8BJQ2 Gm10010-201ENSMUST00000071101 2346 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp1Q8BJQ2 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Tmem40-202ENSMUST00000112946 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Usp1Q8BJQ2 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Rps15-201ENSMUST00000062674 572 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Cox6b1-201ENSMUST00000075738 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Qsox1-207ENSMUST00000194632 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Snx8-205ENSMUST00000196566 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Irx3os-201ENSMUST00000062522 2988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 BC001981-202ENSMUST00000191393 1545 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Lrriq4-202ENSMUST00000108267 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Hoxaas3-202ENSMUST00000136806 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Usp1Q8BJQ2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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