Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGU0

Cyp4f39, Cytochrome P450, family 4, subfamily f, polypeptide 39, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cyp4f39Q8BGU0 Plekhb1-207ENSMUST00000116287 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Chtf8-202ENSMUST00000175940 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16137-201ENSMUST00000161571 664 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5866-201ENSMUST00000177881 973 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Endou-202ENSMUST00000100249 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Plxdc2-203ENSMUST00000114703 2061 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Prrg4-201ENSMUST00000028593 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Zfp707-202ENSMUST00000109967 1703 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Ubl4b-201ENSMUST00000052853 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Hist3h2bb-ps-201ENSMUST00000117558 465 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm28630-201ENSMUST00000187806 498 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 1700028E10Rik-205ENSMUST00000202024 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Atp2b3-202ENSMUST00000088429 4483 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf123-214ENSMUST00000162355 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf34-201ENSMUST00000031434 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Camta1-203ENSMUST00000105668 4962 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Guca1b-201ENSMUST00000024774 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Dclk1-211ENSMUST00000199169 1499 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Ifnar2-202ENSMUST00000089042 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm11682-201ENSMUST00000144689 516 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Mir8102-201ENSMUST00000184148 139 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Cfd-201ENSMUST00000061653 922 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Mfrp-202ENSMUST00000161381 4254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Arxes2-201ENSMUST00000058119 1532 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Dab1-203ENSMUST00000106830 5278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Clec2h-201ENSMUST00000032518 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Sh2b3-202ENSMUST00000086310 4195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Cyp4f39Q8BGU0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 161 ms