Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW8

H2-M10.4, Histocompatibility 2, M region locus 10.4, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.4Q85ZW8 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ghr-203ENSMUST00000110698 1171 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm7488-201ENSMUST00000117148 684 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 4930527A07Rik-201ENSMUST00000130677 559 ntTSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17344-202ENSMUST00000173980 621 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 AC154806.6-201ENSMUST00000228192 202 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Oxt-201ENSMUST00000028764 537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tgif2-ps2-201ENSMUST00000061746 711 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rps7-ps2-201ENSMUST00000219719 1347 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Snx29-207ENSMUST00000180792 2667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Crybb3-203ENSMUST00000118226 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cpsf4l-205ENSMUST00000173655 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm15294-202ENSMUST00000182079 366 ntAPPRIS P1 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tmem253-203ENSMUST00000227295 704 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Crybb3-201ENSMUST00000076069 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Strap-201ENSMUST00000064910 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Taco1-201ENSMUST00000002048 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Pxn-213ENSMUST00000202564 2126 ntTSL 5 BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Gm14812-201ENSMUST00000156494 1794 ntTSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.28□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Epha1-203ENSMUST00000204357 2948 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Lrch4-202ENSMUST00000175968 2036 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.44
H2-M10.4Q85ZW8 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm44645-201ENSMUST00000205492 1653 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Rpl34-203ENSMUST00000133802 711 ntTSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Naxd-205ENSMUST00000178721 1108 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gltpd2-202ENSMUST00000179000 794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Gm45785-201ENSMUST00000209690 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Cartpt-201ENSMUST00000022150 827 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Cartpt-202ENSMUST00000224142 1238 ntAPPRIS P1 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Crat-202ENSMUST00000102854 2160 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Rpa2-201ENSMUST00000102561 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
H2-M10.4Q85ZW8 S100b-201ENSMUST00000036387 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms