Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZI1

Trnp1, TMF-regulated nuclear protein 1, mousemouse

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trnp1Q80ZI1 Cryaa-201ENSMUST00000019192 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trnp1Q80ZI1 Gm38002-201ENSMUST00000193255 180 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trnp1Q80ZI1 1600017P15Rik-202ENSMUST00000193960 890 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trnp1Q80ZI1 Gm43822-201ENSMUST00000200285 476 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Trnp1Q80ZI1 Cebpe-201ENSMUST00000064290 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trnp1Q80ZI1 Gm12280-201ENSMUST00000155836 1624 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trnp1Q80ZI1 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trnp1Q80ZI1 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trnp1Q80ZI1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trnp1Q80ZI1 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trnp1Q80ZI1 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trnp1Q80ZI1 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trnp1Q80ZI1 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Trnp1Q80ZI1 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Fam3a-205ENSMUST00000114142 1586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Skor1-203ENSMUST00000119146 3610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Ablim2-213ENSMUST00000150146 415 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm6152-201ENSMUST00000151704 340 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Ssr4-208ENSMUST00000166518 800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm17180-201ENSMUST00000172211 435 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm29705-201ENSMUST00000212598 474 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Tpd52l1-205ENSMUST00000215515 857 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 AC155237.1-201ENSMUST00000226196 1279 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Allc-202ENSMUST00000110917 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 9330020H09Rik-201ENSMUST00000163781 2147 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Lonrf3-201ENSMUST00000016383 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 AC161252.3-201ENSMUST00000225465 1549 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Ftcd-201ENSMUST00000001183 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Arpc3-203ENSMUST00000111713 708 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm10156-201ENSMUST00000122364 462 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm38266-201ENSMUST00000194931 421 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm42303-201ENSMUST00000209960 1170 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Sct-204ENSMUST00000211667 506 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 1700018B08Rik-201ENSMUST00000034265 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Ntng2-201ENSMUST00000048455 1770 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 1500015A07Rik-201ENSMUST00000184181 1865 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Bet1l-201ENSMUST00000026557 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Degs2-202ENSMUST00000167978 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Retreg1-202ENSMUST00000110438 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Clcn2-201ENSMUST00000007207 3128 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm10339-203ENSMUST00000225409 1671 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Cmc4-203ENSMUST00000149863 507 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm26830-201ENSMUST00000180389 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Trnp1Q80ZI1 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms