Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z64

Nanog, Homeobox protein NANOG, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NanogQ80Z64 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Psmd12-201ENSMUST00000021063 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Adamts7-208ENSMUST00000167122 5338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Nudt18-201ENSMUST00000089049 3926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Mgat3-201ENSMUST00000044970 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Rbmx-202ENSMUST00000114726 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Ehbp1l1-201ENSMUST00000049295 6404 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Wapl-205ENSMUST00000169910 4066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 B3galnt2-201ENSMUST00000099747 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Prkacb-202ENSMUST00000102515 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Grm5-204ENSMUST00000155358 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Gucy2e-201ENSMUST00000021259 8331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Canx-205ENSMUST00000179865 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Slc4a1ap-201ENSMUST00000114533 2424 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Tle3-204ENSMUST00000159386 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
NanogQ80Z64 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Amz1-201ENSMUST00000060918 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC13.15□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Pcdh19-202ENSMUST00000149154 10289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Trim52-201ENSMUST00000022708 3075 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Slc38a10-204ENSMUST00000103018 4578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Bcl11a-202ENSMUST00000109514 5989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gm15406-202ENSMUST00000202229 767 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Sbk1-201ENSMUST00000056028 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Pag1-204ENSMUST00000161949 8256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Dnmt3b-206ENSMUST00000103151 3956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Zfp367-201ENSMUST00000059817 3532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
NanogQ80Z64 Adamts8-201ENSMUST00000068135 3631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
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