Protein–RNA interactions for Protein: Q80UW8

Polr2e, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr2eQ80UW8 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm15957-201ENSMUST00000118893 974 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm29585-201ENSMUST00000185270 514 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Ilkap-208ENSMUST00000187306 377 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm44855-201ENSMUST00000205725 362 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 AI467606-202ENSMUST00000206102 832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 AC124732.1-201ENSMUST00000221551 910 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Erp29-201ENSMUST00000052590 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Ptbp3-205ENSMUST00000148331 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Doc2b-201ENSMUST00000021209 4361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Itpk1-201ENSMUST00000046518 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Ccdc171-204ENSMUST00000126429 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Bscl2-201ENSMUST00000086058 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Ap5m1-205ENSMUST00000227431 3757 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Tbk1-201ENSMUST00000020316 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Efcab14-202ENSMUST00000106522 2636 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Rnf180-203ENSMUST00000224662 2734 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Pdlim3-203ENSMUST00000210422 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm7820-201ENSMUST00000121012 1052 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm24694-201ENSMUST00000180054 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm27663-201ENSMUST00000184839 110 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Aip-201ENSMUST00000025767 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Cldn13-201ENSMUST00000008987 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Rnf167-201ENSMUST00000037534 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Trnt1-203ENSMUST00000113248 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Tepsin-203ENSMUST00000106225 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Syt7-205ENSMUST00000224135 1557 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Itm2b-201ENSMUST00000022704 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Prickle1-201ENSMUST00000048982 4085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gstm1-201ENSMUST00000004140 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gbgt1-203ENSMUST00000163121 1335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gale-202ENSMUST00000102541 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Tdrd12-205ENSMUST00000205407 1412 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Opn5-201ENSMUST00000068355 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm4981-201ENSMUST00000099726 1854 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Jun-201ENSMUST00000107094 3189 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Nab1-205ENSMUST00000186764 3640 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Polr2eQ80UW8 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
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