Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Fer-202ENSMUST00000038080 2365 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gfpt1-203ENSMUST00000113657 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Cenpa-206ENSMUST00000149759 346 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ift27-201ENSMUST00000016781 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Rnf2-203ENSMUST00000186415 1106 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ly6f-202ENSMUST00000189654 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Tex12-202ENSMUST00000217236 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm18027-201ENSMUST00000218947 619 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm9797-201ENSMUST00000052902 613 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Olfr1412-201ENSMUST00000062964 966 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Alx1-205ENSMUST00000218282 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Tmem211-201ENSMUST00000086615 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 AC115735.4-201ENSMUST00000227460 1944 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 AC121801.1-201ENSMUST00000225363 1899 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ctnnbip1-202ENSMUST00000105692 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 H2-Pa-201ENSMUST00000182803 626 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 2900092O11Rik-201ENSMUST00000191770 755 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Tcta-203ENSMUST00000195615 597 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Srd5a2-201ENSMUST00000043458 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm10188-201ENSMUST00000086544 720 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Emd-203ENSMUST00000096424 896 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm37411-201ENSMUST00000194180 2282 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Mocs1-201ENSMUST00000024797 2646 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Prn-201ENSMUST00000124100 2132 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gif-201ENSMUST00000025585 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Fam217a-204ENSMUST00000225242 1811 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Cd300lf-203ENSMUST00000106562 1762 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Itfg2-206ENSMUST00000203374 1394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Mettl3-201ENSMUST00000022767 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Rab4a-201ENSMUST00000117702 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Tmem219-204ENSMUST00000121532 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Rpl27a-203ENSMUST00000143107 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm40193-201ENSMUST00000209971 237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm11149-201ENSMUST00000068730 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Pdlim7-202ENSMUST00000069929 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Med8-202ENSMUST00000073881 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Gm4559-201ENSMUST00000080669 600 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Sbds-201ENSMUST00000026387 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ttll4Q80UG8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms