Protein–RNA interactions for Protein: Q80U23

Snph, Syntaphilin, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SnphQ80U23 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Fam133b-201ENSMUST00000115527 1491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Ola1-203ENSMUST00000112055 1251 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm5916-201ENSMUST00000168452 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm5930-202ENSMUST00000178002 489 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Odaph-201ENSMUST00000178614 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 1700121L03Rik-201ENSMUST00000187796 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm37850-201ENSMUST00000194573 549 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 4930566N20Rik-201ENSMUST00000195173 1199 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm43568-203ENSMUST00000199116 1270 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm18539-201ENSMUST00000204745 1090 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 AC123830.1-201ENSMUST00000217156 609 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Olfr812-201ENSMUST00000057775 1043 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Prss48-201ENSMUST00000061343 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Esp6-201ENSMUST00000097324 658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Olfr201-201ENSMUST00000099656 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Pctp-201ENSMUST00000020864 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Ranbp3-201ENSMUST00000002445 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Fgfr2-207ENSMUST00000117872 4223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 6030408B16Rik-202ENSMUST00000191426 1947 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm43738-201ENSMUST00000200659 2635 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Clip2-201ENSMUST00000036999 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gtf2h1-201ENSMUST00000006774 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Slc25a21-202ENSMUST00000110680 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Mup-ps15-201ENSMUST00000121741 539 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm16158-201ENSMUST00000123509 785 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Clec4a2-204ENSMUST00000161365 918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Scgb1b4-ps-201ENSMUST00000186920 271 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm19030-201ENSMUST00000194947 552 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 C030015E24Rik-201ENSMUST00000198148 828 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Olfr684-201ENSMUST00000060893 939 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Ablim1-209ENSMUST00000111546 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Olfr1140-201ENSMUST00000214723 1421 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Gm5605-201ENSMUST00000208940 1305 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SnphQ80U23 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 Ttyh2-201ENSMUST00000045779 3486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 Grm7-201ENSMUST00000071076 3127 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SnphQ80U23 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms