Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm14350-201ENSMUST00000116642 640 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 D930015M05Rik-201ENSMUST00000126002 1190 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Hyal1-204ENSMUST00000144392 1332 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Zfp709-202ENSMUST00000188374 717 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm4610-201ENSMUST00000198222 905 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 AC134335.2-201ENSMUST00000227660 440 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Mir7070-201ENSMUST00000183657 86 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 1500004A13Rik-208ENSMUST00000184958 823 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Gm9176-201ENSMUST00000219955 1120 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Dph3-201ENSMUST00000022461 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Rhbdd3-203ENSMUST00000109878 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
NischQ80TM9 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Polr3c-202ENSMUST00000125183 923 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gm37466-201ENSMUST00000195692 652 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 CT033793.1-201ENSMUST00000216883 565 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 AC131997.1-201ENSMUST00000228611 1229 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Mlx-203ENSMUST00000107303 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gm26576-201ENSMUST00000181018 1977 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gpc6-201ENSMUST00000078849 1668 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Rpl38-204ENSMUST00000106602 371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Keap1-205ENSMUST00000194542 3151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Mlkl-201ENSMUST00000056157 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Prr29-204ENSMUST00000188561 592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Prr29-206ENSMUST00000190795 822 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gm6169-201ENSMUST00000071118 1030 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 H2afv-201ENSMUST00000093346 519 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Egfl7-211ENSMUST00000152988 723 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Pde4b-210ENSMUST00000172616 823 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Cdk3-ps-202ENSMUST00000174177 915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gm9368-201ENSMUST00000219348 831 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Timm10-201ENSMUST00000028470 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Ube2j2-204ENSMUST00000105582 1394 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Prmt2-201ENSMUST00000020452 2016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 4931428F04Rik-203ENSMUST00000212219 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gas8-201ENSMUST00000093043 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gtf2a1l-201ENSMUST00000024970 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Mad2l1bp-201ENSMUST00000171172 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Gm38000-201ENSMUST00000192390 1215 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Slc25a54-201ENSMUST00000029478 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
NischQ80TM9 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
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