Protein–RNA interactions for Protein: Q7TPR4

Actn1, Alpha-actinin-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 892 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actn1Q7TPR4 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Rhpn1-201ENSMUST00000023244 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Zfp410-201ENSMUST00000045931 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Adck5-214ENSMUST00000162503 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Pla2g2e-202ENSMUST00000105803 381 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Myl4-203ENSMUST00000106957 943 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Rgs20-203ENSMUST00000119256 883 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Brix1-201ENSMUST00000022855 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ppp1r8-201ENSMUST00000030702 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Cdk6-201ENSMUST00000042410 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 4833428L15Rik-201ENSMUST00000181230 1259 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Shd-206ENSMUST00000225145 998 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Cald1-201ENSMUST00000031775 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 AC140354.1-201ENSMUST00000219499 2425 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Kcnab2-202ENSMUST00000105648 1576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Actn1Q7TPR4 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Runx2-202ENSMUST00000113571 5898 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ece2-204ENSMUST00000133344 3042 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm6912-201ENSMUST00000117218 544 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Mcfd2-202ENSMUST00000129616 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Flt3l-201ENSMUST00000146760 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm38182-203ENSMUST00000192984 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Pcdhgc5-204ENSMUST00000193941 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Wdr46-201ENSMUST00000025170 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Hnrnph2-201ENSMUST00000050331 1701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Actn1Q7TPR4 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms