Protein–RNA interactions for Protein: Q78YZ6

Scoc, Short coiled-coil protein, mousemouse

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Length 125 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScocQ78YZ6 Gm6198-201ENSMUST00000191337 2929 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Tial1-203ENSMUST00000106228 2835 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Kcnt1-201ENSMUST00000037580 5881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Saa2-203ENSMUST00000210769 652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Saa2-201ENSMUST00000075982 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Rubcn-202ENSMUST00000089684 5311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Arap1-204ENSMUST00000107010 5147 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Sept12-201ENSMUST00000170323 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm19461-205ENSMUST00000191207 2566 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Bmp3-202ENSMUST00000197143 2739 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Mkrn1-201ENSMUST00000031985 3046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 S1pr3-201ENSMUST00000087978 4463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Klhl12-201ENSMUST00000027725 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Unc5c-202ENSMUST00000106236 9646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Zfp385b-203ENSMUST00000111830 2642 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Ppt2-210ENSMUST00000171376 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gps1-201ENSMUST00000100134 1925 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gcat-201ENSMUST00000006544 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Pou2f3-202ENSMUST00000176636 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Sema3b-205ENSMUST00000102532 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm43364-201ENSMUST00000196046 3274 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Adprhl1-205ENSMUST00000204916 5228 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Slc6a7-201ENSMUST00000025520 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Samd4b-204ENSMUST00000208199 4391 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Slc34a1-201ENSMUST00000057167 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Foxi2-201ENSMUST00000060356 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Oxr1-204ENSMUST00000110297 4596 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Rasl10b-203ENSMUST00000164425 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Slc25a25-204ENSMUST00000113308 2643 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm26905-201ENSMUST00000180798 6621 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Dysf-216ENSMUST00000204987 6474 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Inpp5e-205ENSMUST00000145701 4147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Mast1-201ENSMUST00000109741 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Nckap5l-201ENSMUST00000023747 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Gm11405-201ENSMUST00000118689 1556 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
ScocQ78YZ6 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms