Protein–RNA interactions for Protein: Q78Y63

Pdcl2, Phosducin-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl2Q78Y63 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Tpk1-201ENSMUST00000067888 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Aoc2-202ENSMUST00000107264 2230 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Il34-204ENSMUST00000150680 1796 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Cant1-202ENSMUST00000092378 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Rpusd2-201ENSMUST00000028796 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Tcirg1-201ENSMUST00000001801 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Cd3d-201ENSMUST00000034602 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gm1113-201ENSMUST00000183573 2434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 AC116503.1-201ENSMUST00000215445 2192 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Cdx4-201ENSMUST00000033689 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Got1-201ENSMUST00000026196 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Ptbp2-201ENSMUST00000029780 3364 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Capn3-203ENSMUST00000090028 2640 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Abcg8-202ENSMUST00000170725 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Tfdp2-203ENSMUST00000165768 2212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Mtch2-211ENSMUST00000150232 2377 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Mdm2-201ENSMUST00000020408 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Aldh6a1-201ENSMUST00000085192 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Pde8b-207ENSMUST00000162153 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Begain-204ENSMUST00000209829 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Ehd1-201ENSMUST00000025684 3353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Psd2-206ENSMUST00000177432 4367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Cep170b-204ENSMUST00000220627 5395 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Aph1a-202ENSMUST00000056710 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Pgm5-201ENSMUST00000047666 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Ccdc22-201ENSMUST00000033483 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Osbpl7-201ENSMUST00000090020 3771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Gria4-203ENSMUST00000163309 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Pigh-201ENSMUST00000072154 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Slc4a1ap-209ENSMUST00000202214 2806 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Ibsp-201ENSMUST00000031246 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Ldlrap1-201ENSMUST00000037828 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Spock1-206ENSMUST00000189373 3128 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 4930412M03Rik-201ENSMUST00000130746 1111 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Nmi-205ENSMUST00000145481 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Pdcl2Q78Y63 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms