Protein–RNA interactions for Protein: Q78PY7

Snd1, Staphylococcal nuclease domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 910 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snd1Q78PY7 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Mfsd4b4-202ENSMUST00000178563 3523 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Keap1-202ENSMUST00000164812 3614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gm42872-201ENSMUST00000200026 1967 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Rrp1-201ENSMUST00000062678 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Snd1Q78PY7 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gata2-202ENSMUST00000170089 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Caprin2-202ENSMUST00000111569 3697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Igf2os-203ENSMUST00000141681 4778 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Kcnj9-202ENSMUST00000194204 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm23935-201ENSMUST00000102303 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm24270-201ENSMUST00000102326 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm24245-201ENSMUST00000157318 57 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Slc37a1-201ENSMUST00000165149 3354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm39244-202ENSMUST00000210837 1857 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Rufy3-203ENSMUST00000196894 3703 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Ak1-202ENSMUST00000113277 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Slc39a8-202ENSMUST00000081978 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Tmem38b-201ENSMUST00000030127 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Wdr36-202ENSMUST00000166214 2942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Dlk1-205ENSMUST00000109844 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Zfp467-203ENSMUST00000114558 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 9330162012Rik-201ENSMUST00000154919 3836 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Eif4e3-201ENSMUST00000032151 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Hdac10-202ENSMUST00000109347 1824 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Rbl2-208ENSMUST00000209518 4792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Ociad2-201ENSMUST00000087195 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Ska1-201ENSMUST00000040188 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Tcn2-204ENSMUST00000109990 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Wbp11-201ENSMUST00000116514 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Zbtb17-201ENSMUST00000006377 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Kcnc4-201ENSMUST00000009617 3667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm38577-201ENSMUST00000221531 4545 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Zfp169-203ENSMUST00000176176 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Pax6-201ENSMUST00000090391 2869 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Cnnm2-202ENSMUST00000099373 3558 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm2420-202ENSMUST00000202224 2249 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Celf4-203ENSMUST00000223704 2492 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Taf3-201ENSMUST00000026888 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Nup98-206ENSMUST00000211235 3748 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Gm21983-201ENSMUST00000154724 1690 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Epsti1-201ENSMUST00000022591 1870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 BC006965-201ENSMUST00000124028 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Cyp4x1os-201ENSMUST00000153951 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Tcf4-248ENSMUST00000202354 2120 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Snd1Q78PY7 Tcf4-257ENSMUST00000202772 2125 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.7 ms