Protein–RNA interactions for Protein: Q78JW9

Ubfd1, Ubiquitin domain-containing protein UBFD1, mousemouse

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Length 368 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubfd1Q78JW9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Espn-220ENSMUST00000207676 4618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 4930423C22Rik-201ENSMUST00000193863 1311 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Rgs6-216ENSMUST00000200911 2626 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Hoxa7-203ENSMUST00000140316 643 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Ighv8-14-201ENSMUST00000196781 358 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Gm45195-201ENSMUST00000205597 1008 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Il18r1-204ENSMUST00000193391 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Ubfd1Q78JW9 Gjb4-202ENSMUST00000106090 1446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gjb4-201ENSMUST00000060419 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Ebf4-202ENSMUST00000110287 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Sytl1-201ENSMUST00000030674 1951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Alx1-208ENSMUST00000219194 1695 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Mrpl53-201ENSMUST00000113938 695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Trp53tg5-201ENSMUST00000017864 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gm29542-201ENSMUST00000186876 704 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gm32591-204ENSMUST00000208679 1806 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 4921513I03Rik-201ENSMUST00000056994 1534 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Dusp23-201ENSMUST00000027826 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 E2f3-203ENSMUST00000221536 4597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 E2f3-204ENSMUST00000222730 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Klf4-201ENSMUST00000107619 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ubfd1Q78JW9 Cep295nl-201ENSMUST00000103024 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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Ubfd1Q78JW9 Spaca3-202ENSMUST00000103223 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gm22189-201ENSMUST00000103822 86 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gm5678-201ENSMUST00000120115 939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gm12352-201ENSMUST00000154452 760 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Dynlt1b-201ENSMUST00000179569 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Inpp4a-213ENSMUST00000193774 1243 ntTSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gtpbp10-211ENSMUST00000198799 648 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gm29682-201ENSMUST00000210896 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 AC165157.4-201ENSMUST00000220587 139 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Obp2a-201ENSMUST00000077667 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Daxx-208ENSMUST00000174541 2325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Gpr108-201ENSMUST00000005975 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
Ubfd1Q78JW9 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.87□□□□□ -0.19
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