Protein–RNA interactions for Protein: Q6VGS5

Ccdc88c, Protein Daple, mousemouse

Predictions only

Length 2,009 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc88cQ6VGS5 Col9a2-201ENSMUST00000030372 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Orc6-202ENSMUST00000170141 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15460-201ENSMUST00000118147 391 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Fbxw4-209ENSMUST00000162433 789 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Arf5-202ENSMUST00000169841 768 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Bpnt1-205ENSMUST00000210277 1226 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 AC154846.1-201ENSMUST00000226278 862 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Maged2-203ENSMUST00000112699 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Irak1-206ENSMUST00000114354 3835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Trav3d-3-201ENSMUST00000103599 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Trav3n-3-201ENSMUST00000103625 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Tmem128-202ENSMUST00000119047 726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Trav3-3-202ENSMUST00000183835 276 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Slc4a2-201ENSMUST00000080067 4179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Wbp2nl-201ENSMUST00000023089 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm29154-231ENSMUST00000215120 1367 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Traf1-201ENSMUST00000028234 2069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Hp1bp3-202ENSMUST00000097836 3113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Myg1-202ENSMUST00000113682 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ckmt2-201ENSMUST00000022122 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Fam122b-203ENSMUST00000114841 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Rad17-202ENSMUST00000177848 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Cep295nl-202ENSMUST00000168100 1602 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1d-201ENSMUST00000018274 3675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Stat3-201ENSMUST00000092671 2927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15440-201ENSMUST00000110042 1231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 2700012I20Rik-201ENSMUST00000180525 684 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Cxcl17-202ENSMUST00000200880 760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Mpv17-207ENSMUST00000201491 923 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Cxcl17-201ENSMUST00000074040 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Nsd3-211ENSMUST00000155861 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 B230359F08Rik-201ENSMUST00000103671 426 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ppp1r14d-202ENSMUST00000110820 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm11524-201ENSMUST00000119349 807 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Mir497b-201ENSMUST00000093601 125 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Pef1-202ENSMUST00000118199 1915 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Asprv1-201ENSMUST00000043400 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Plxdc1-203ENSMUST00000107565 2439 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Egfem1-201ENSMUST00000118531 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Tnip2-201ENSMUST00000030991 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 4933430H06Rik-201ENSMUST00000200924 1343 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Bbs5-201ENSMUST00000074963 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Lpar1-201ENSMUST00000055018 3512 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Men1-207ENSMUST00000113503 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Cenpl-203ENSMUST00000111620 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gatd1-201ENSMUST00000106008 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Ccdc88cQ6VGS5 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms