Protein–RNA interactions for Protein: Q6S5G4

Gja6, Gap junction alpha-6 protein, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja6Q6S5G4 Tbx6-201ENSMUST00000094037 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm8131-201ENSMUST00000213783 1570 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Dhrs2-202ENSMUST00000165432 849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Mir7654-201ENSMUST00000185082 70 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Polr2h-201ENSMUST00000021405 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 AC102291.3-201ENSMUST00000226566 405 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Zfp296-201ENSMUST00000108453 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Gja6Q6S5G4 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Nfe2-205ENSMUST00000133600 1605 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gnb4-201ENSMUST00000108234 2510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Wfdc3-201ENSMUST00000103096 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm37714-201ENSMUST00000194742 342 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm42921-201ENSMUST00000196670 655 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Ndufa4l2-201ENSMUST00000035735 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Jaml-204ENSMUST00000215880 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm14224-201ENSMUST00000147187 864 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm5035-201ENSMUST00000215581 927 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Tmem139-201ENSMUST00000095987 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 S100a16-201ENSMUST00000098910 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Map3k8-201ENSMUST00000025078 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm14451-201ENSMUST00000121581 1542 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Slc35g3-201ENSMUST00000102586 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Dmrtc2-201ENSMUST00000011493 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Gm18307-201ENSMUST00000206864 949 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gja6Q6S5G4 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms