Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Gm46209-201ENSMUST00000217912 553 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Mir125a-201ENSMUST00000083545 68 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Lancl3-201ENSMUST00000069763 3991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Dap3-207ENSMUST00000173135 1409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Aifm3-202ENSMUST00000115685 2357 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Cant1-201ENSMUST00000017620 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Psmd8-202ENSMUST00000182328 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Tars2-204ENSMUST00000163530 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Prss44-201ENSMUST00000098345 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Prkcd-207ENSMUST00000112210 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Rreb1-202ENSMUST00000110237 4617 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Cldn14-201ENSMUST00000050962 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 B130055M24Rik-201ENSMUST00000144796 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Pgap2-225ENSMUST00000156529 2034 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm37117-201ENSMUST00000194238 589 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm45751-201ENSMUST00000210185 1573 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Pim2-204ENSMUST00000223553 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Bccip-201ENSMUST00000033282 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Hist1h3f-201ENSMUST00000075558 1261 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 S100a7a-201ENSMUST00000079286 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gspt2-201ENSMUST00000096368 2491 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Serhl-201ENSMUST00000078218 1371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Rplp0-201ENSMUST00000086519 1358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Pglyrp2-201ENSMUST00000114455 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Il18r1-203ENSMUST00000167723 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Nfe2l1-201ENSMUST00000081775 4654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Mdm1-208ENSMUST00000219087 1318 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Pid1-204ENSMUST00000176559 1564 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Pex3-202ENSMUST00000105539 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Echdc1-202ENSMUST00000160399 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Arf2-201ENSMUST00000057921 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 AC121598.1-201ENSMUST00000228224 1019 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm5763-201ENSMUST00000155951 1530 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Spag1-202ENSMUST00000171205 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Jpt1-201ENSMUST00000021083 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Fundc1-201ENSMUST00000026016 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Dnmt3a-205ENSMUST00000172689 2328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Nt5dc2-201ENSMUST00000090212 1407 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Krt9Q6RHW0 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms