Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDS3

Sarm1, Sterile alpha and TIR motif-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 724 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sarm1Q6PDS3 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Taf6-201ENSMUST00000048698 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Metrnl-202ENSMUST00000106089 1101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm6415-201ENSMUST00000118488 348 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm26771-201ENSMUST00000180472 1082 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm45098-201ENSMUST00000207179 657 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Rps27l-201ENSMUST00000040917 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Ggh-201ENSMUST00000098242 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Gm9913-201ENSMUST00000066157 2793 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Sarm1Q6PDS3 Cox16-201ENSMUST00000002757 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Trim24-203ENSMUST00000120428 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Stx5a-201ENSMUST00000010254 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Tub-202ENSMUST00000119474 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm28277-201ENSMUST00000187450 885 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Rpl32-202ENSMUST00000203816 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 AC158529.1-201ENSMUST00000223618 239 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Mrpl4-201ENSMUST00000003386 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm29253-201ENSMUST00000185727 5231 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Dmkn-204ENSMUST00000085691 2007 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Rab9b-201ENSMUST00000058814 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Ptp4a1-202ENSMUST00000076587 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Tmod2-207ENSMUST00000215462 1564 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 H60b-201ENSMUST00000105522 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Ninj2-202ENSMUST00000112711 853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Ube2v2-202ENSMUST00000115776 1236 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm8410-201ENSMUST00000117225 605 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm6539-201ENSMUST00000119157 1064 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Hras-203ENSMUST00000124314 1073 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Rph3al-202ENSMUST00000066504 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Chchd5-201ENSMUST00000035481 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Cbs-201ENSMUST00000067801 2497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Foxred2-201ENSMUST00000016696 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Sarm1Q6PDS3 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms