Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5B0

Rrp12, RRP12-like protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,295 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp12Q6P5B0 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Pnoc-201ENSMUST00000059339 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Glud1-201ENSMUST00000022322 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Mcf2l-207ENSMUST00000110876 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Lime1-201ENSMUST00000048077 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Rph3a-203ENSMUST00000202326 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Sdha-201ENSMUST00000022062 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Slc25a18-201ENSMUST00000112682 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Washc3-202ENSMUST00000171151 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Senp5-201ENSMUST00000023457 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm20632-201ENSMUST00000176760 2427 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Osbp2-202ENSMUST00000101632 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Trem1-202ENSMUST00000113251 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Pkp3-202ENSMUST00000106039 2919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 AC130669.1-201ENSMUST00000228537 1672 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Ankrd6-202ENSMUST00000084748 4354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Pcsk6-202ENSMUST00000098391 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Rbl1-201ENSMUST00000029170 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm15850-201ENSMUST00000134998 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gorab-201ENSMUST00000045138 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Cfap69-201ENSMUST00000054865 4956 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Tmem19-203ENSMUST00000217884 2799 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Src-202ENSMUST00000092576 3887 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Rrp12Q6P5B0 Rabggta-202ENSMUST00000163889 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Celf1-214ENSMUST00000177642 7806 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Rbm33-201ENSMUST00000030920 3955 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Lag3-201ENSMUST00000032217 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Rrp12Q6P5B0 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms