Protein–RNA interactions for Protein: Q6P3A8

Bckdhb, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit beta, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdhbQ6P3A8 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Galt-201ENSMUST00000084695 1595 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Hus1b-201ENSMUST00000102943 1187 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Myadml2os-201ENSMUST00000126642 1044 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Gm27206-201ENSMUST00000154038 979 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Gm44756-201ENSMUST00000206172 1069 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 AC153527.1-201ENSMUST00000220412 602 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 AC110817.1-201ENSMUST00000225706 605 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Mettl26-201ENSMUST00000026827 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Ifitm10-202ENSMUST00000084412 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
BckdhbQ6P3A8 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.46□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Nov-201ENSMUST00000050027 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Mettl2-201ENSMUST00000021030 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Fam24a-203ENSMUST00000207784 600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Med10-201ENSMUST00000022089 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 1700011B04Rik-206ENSMUST00000221013 824 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Sit1-201ENSMUST00000030180 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 2810006K23Rik-202ENSMUST00000111477 1637 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Chrna3-202ENSMUST00000214204 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Disp2-202ENSMUST00000063975 1505 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Rgs6-203ENSMUST00000185665 2201 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Spag8-202ENSMUST00000107870 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Mup-ps23-201ENSMUST00000118063 630 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Gm14660-201ENSMUST00000119809 575 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Gm14617-202ENSMUST00000144208 607 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Gm17409-201ENSMUST00000167423 962 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Pyy-204ENSMUST00000177304 551 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 AC154171.1-201ENSMUST00000224610 643 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Gm8225-201ENSMUST00000090257 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Pnck-201ENSMUST00000002087 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Zfp422-203ENSMUST00000112880 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
BckdhbQ6P3A8 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms