Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Vav1-201ENSMUST00000005889 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Nfatc4-204ENSMUST00000226357 2680 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Srsf10-204ENSMUST00000105853 3058 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Wac-201ENSMUST00000074919 3070 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Pomc-201ENSMUST00000020990 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Mto1-201ENSMUST00000034896 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Casc4-203ENSMUST00000089915 3475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Trmt1-205ENSMUST00000125370 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Prpf31-202ENSMUST00000108636 1798 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Erich6-201ENSMUST00000041115 2195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Cdk5r1-201ENSMUST00000053413 4162 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Arpc1b-201ENSMUST00000085679 3105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 CT025626.1-201ENSMUST00000223735 1455 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Cdk11b-203ENSMUST00000105600 3170 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Hist1h1e-201ENSMUST00000062045 1930 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Ociad2-204ENSMUST00000200830 2384 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Marveld3-202ENSMUST00000051430 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Pcsk4-201ENSMUST00000020340 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Tmem2-202ENSMUST00000096194 6667 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Snrpn-202ENSMUST00000098402 2076 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Tnn-201ENSMUST00000039178 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 4930556H04Rik-201ENSMUST00000222451 1675 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Tpm3-201ENSMUST00000029549 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Cblb-204ENSMUST00000227062 3728 ntAPPRIS P2 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Fhad1-202ENSMUST00000105779 4263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Tbrg4-201ENSMUST00000000394 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Nfya-203ENSMUST00000159063 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Btbd10-201ENSMUST00000047091 2581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gpank1-202ENSMUST00000165306 1518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Kcnj12-201ENSMUST00000041944 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Setd1b-204ENSMUST00000163030 8857 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Tex22-202ENSMUST00000109729 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Hoxa7-202ENSMUST00000134367 807 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Caly-201ENSMUST00000026541 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Tmod4-201ENSMUST00000005769 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Tuft1-203ENSMUST00000196655 2156 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Lysmd3-201ENSMUST00000049055 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Wsb1-201ENSMUST00000017821 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 1110008P14Rik-202ENSMUST00000146423 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sec23ipQ6NZC7 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms