Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW5

Atp11b, Phospholipid-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,175 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp11bQ6DFW5 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Gm29374-201ENSMUST00000187198 1340 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Eef1d-204ENSMUST00000089681 2152 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Ppp1r18-206ENSMUST00000190496 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Atp11bQ6DFW5 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Surf2-201ENSMUST00000015017 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Kctd17-202ENSMUST00000159771 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Gm6283-201ENSMUST00000182369 1000 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 AC156560.2-201ENSMUST00000221232 264 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Iqcf4-201ENSMUST00000085111 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Tssk4-202ENSMUST00000164809 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Atp11bQ6DFW5 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Mier2-201ENSMUST00000062855 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 AC131068.2-201ENSMUST00000226175 1453 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Kcnq1-202ENSMUST00000185383 1535 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Mif4gd-202ENSMUST00000106506 993 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 H60b-202ENSMUST00000131558 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atp11bQ6DFW5 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atp11bQ6DFW5 Gm17794-201ENSMUST00000220252 955 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Ngf-201ENSMUST00000035952 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atp11bQ6DFW5 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Atp11bQ6DFW5 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Atp11bQ6DFW5 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Apoo-204ENSMUST00000113898 784 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Ifnar2-203ENSMUST00000117836 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Gm12390-201ENSMUST00000117897 397 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Ercc1-203ENSMUST00000160369 1175 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Gm4804-201ENSMUST00000182234 999 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Gm29481-201ENSMUST00000189080 1049 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Elane-201ENSMUST00000046091 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Atp11bQ6DFW5 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms