Protein–RNA interactions for Protein: Q68FH0

Pkp4, Plakophilin-4, mousemouse

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Length 1,190 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp4Q68FH0 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Adra1b-204ENSMUST00000167574 3047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Olfr1156-203ENSMUST00000216726 3271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gak-201ENSMUST00000046603 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Rhobtb1-210ENSMUST00000167384 2331 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Arpc4-203ENSMUST00000203578 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Grin2c-201ENSMUST00000003351 4279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Raf1-201ENSMUST00000000451 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Tdrp-201ENSMUST00000062613 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Tgif2-201ENSMUST00000073352 2690 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 2810408I11Rik-202ENSMUST00000150749 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Dnmt3b-203ENSMUST00000081628 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Hes2-201ENSMUST00000030782 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Hcrtr1-201ENSMUST00000030562 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Cep164-204ENSMUST00000213154 6105 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Aptx-201ENSMUST00000030119 5250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 R3hcc1-202ENSMUST00000121142 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Kpna6-201ENSMUST00000003828 2195 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Mmp14-206ENSMUST00000225641 3238 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Papd5-201ENSMUST00000066748 4489 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Sh2b1-204ENSMUST00000205497 2854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm2810-201ENSMUST00000118681 990 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 H2af-ps-201ENSMUST00000119066 295 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Map2k3os-201ENSMUST00000123544 1291 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Lman2-201ENSMUST00000021940 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Klhdc4-210ENSMUST00000174717 1662 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Pkp4Q68FH0 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Prok2-202ENSMUST00000032152 1423 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Add3-202ENSMUST00000050096 4488 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ssr1-204ENSMUST00000225319 1610 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ak1-201ENSMUST00000068271 2034 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm26847-201ENSMUST00000180407 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm28182-201ENSMUST00000188354 2477 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Krt71-201ENSMUST00000023710 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Tnks1bp1-202ENSMUST00000111605 5747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Zkscan7-202ENSMUST00000215872 4035 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Pkp4Q68FH0 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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