Protein–RNA interactions for Protein: Q68FG2

Sptbn2, Spectrin beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 2,388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptbn2Q68FG2 4930447A16Rik-201ENSMUST00000022897 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Fam241b-202ENSMUST00000064050 1096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.78□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Sgce-205ENSMUST00000115579 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Gm15816-201ENSMUST00000141930 1688 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Tmem159-202ENSMUST00000118737 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Skida1-202ENSMUST00000091420 4376 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Islr2-210ENSMUST00000215950 4109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Gm12585-201ENSMUST00000117307 290 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Gm45720-201ENSMUST00000211881 484 ntTSL 3 BASIC12.77□□□□□ -0.36
Sptbn2Q68FG2 Gm43289-201ENSMUST00000200537 1475 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Adgrg5-205ENSMUST00000166802 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ptcd2-201ENSMUST00000022153 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Sptb-201ENSMUST00000021458 10394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Steap2-203ENSMUST00000115425 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Mhrt-201ENSMUST00000181782 828 ntTSL 2 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm2762-202ENSMUST00000201517 2339 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm8775-201ENSMUST00000170943 1327 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Nrxn1-207ENSMUST00000160844 9309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Fgfr1op2-203ENSMUST00000067404 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ciart-202ENSMUST00000159739 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Yif1a-201ENSMUST00000025811 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm16091-201ENSMUST00000156664 963 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 1700034G24Rik-202ENSMUST00000183186 1081 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 1700030C10Rik-202ENSMUST00000186243 126 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm7556-201ENSMUST00000201178 1084 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rdh5-201ENSMUST00000026406 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Mybphl-201ENSMUST00000090563 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Fam208a-201ENSMUST00000022450 7590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Map2k7-211ENSMUST00000145165 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rdh18-ps-201ENSMUST00000137395 944 ntBASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rdh18-ps-202ENSMUST00000143917 953 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm20652-201ENSMUST00000177314 383 ntTSL 2 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Gm7993-201ENSMUST00000200970 1384 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Sptbn2Q68FG2 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms