Protein–RNA interactions for Protein: Q62255

Sall3, Sal-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sall3Q62255 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Pccb-204ENSMUST00000149322 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Apol7a-201ENSMUST00000010745 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Trim15-203ENSMUST00000174195 1778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Fh1-201ENSMUST00000027810 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Car4-201ENSMUST00000103194 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Gm4971-201ENSMUST00000205991 1108 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Nanos3-201ENSMUST00000070102 730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Olfr554-201ENSMUST00000098221 954 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Alox5-201ENSMUST00000026795 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Syce1-201ENSMUST00000026553 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Kctd18-202ENSMUST00000114410 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Ankrd50-201ENSMUST00000094300 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Ctgf-201ENSMUST00000020171 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Trp73-201ENSMUST00000097762 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Sall3Q62255 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 2610306M01Rik-201ENSMUST00000185414 1042 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Gm29417-201ENSMUST00000188160 571 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Gm15411-202ENSMUST00000201913 668 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Apoa5-203ENSMUST00000213878 727 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Cuedc2-201ENSMUST00000051234 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Trf-201ENSMUST00000035158 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Arhgap8-205ENSMUST00000168811 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Sgce-202ENSMUST00000090686 1547 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Hsd3b7-203ENSMUST00000106272 1725 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Sall3Q62255 Bik-201ENSMUST00000016902 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Sall3Q62255 9430085M18Rik-201ENSMUST00000198824 1178 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Csrp3-201ENSMUST00000032658 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
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Sall3Q62255 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
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Sall3Q62255 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Lims1-203ENSMUST00000105468 1205 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 3110009E18Rik-203ENSMUST00000112644 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Leng8-202ENSMUST00000117274 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Gm27847-201ENSMUST00000183711 107 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Gm27375-201ENSMUST00000183799 107 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Gm8598-201ENSMUST00000221184 836 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Haus7-202ENSMUST00000077243 1032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Apbb1-215ENSMUST00000190369 1882 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Pias3-203ENSMUST00000107077 2695 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Gpr160-203ENSMUST00000108259 1916 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Sall3Q62255 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 67.3 ms