Protein–RNA interactions for Protein: Q62209

Sycp1, Synaptonemal complex protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 993 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sycp1Q62209 Crybg1-202ENSMUST00000200401 7525 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Dnase1l2-202ENSMUST00000119932 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Leng9-201ENSMUST00000058358 2460 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Cfl1-202ENSMUST00000209469 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Padi4-201ENSMUST00000026381 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Egfl7-212ENSMUST00000166920 1391 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Arhgap40-203ENSMUST00000165398 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Necap2-201ENSMUST00000030760 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Anks1b-204ENSMUST00000179337 2692 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 St6gal2-202ENSMUST00000086878 2606 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gpr153-202ENSMUST00000105650 3838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Pdia2-202ENSMUST00000120333 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm17396-201ENSMUST00000172075 1655 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Tbc1d16-203ENSMUST00000207655 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Plppr2-202ENSMUST00000188468 1480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ahdc1-204ENSMUST00000105916 6602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ighv4-1-201ENSMUST00000103464 414 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Tmem242-201ENSMUST00000005053 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ube2l6-201ENSMUST00000102642 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Edn3-201ENSMUST00000029030 3117 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Coq6-203ENSMUST00000110278 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Fbxl19-203ENSMUST00000186207 3178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm26308-201ENSMUST00000157768 69 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm5479-201ENSMUST00000160578 435 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Mpped1-210ENSMUST00000172115 795 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Mpped1-211ENSMUST00000172398 795 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm34397-203ENSMUST00000214991 630 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Olfr324-201ENSMUST00000054683 1122 ntAPPRIS P2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Sphk1-205ENSMUST00000106387 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Cacna1g-206ENSMUST00000107788 8050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Cacna1g-211ENSMUST00000107793 8071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Tfap2a-201ENSMUST00000021787 3487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Nt5c2-203ENSMUST00000172239 3148 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Ppp2r5b-201ENSMUST00000025695 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Gm16845-201ENSMUST00000180419 1415 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Fbxo25-201ENSMUST00000043520 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 3830417A13Rik-201ENSMUST00000033522 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Aff2-201ENSMUST00000033532 4523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Fndc7-201ENSMUST00000053065 3009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Yap1-202ENSMUST00000086580 4115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Sycp1Q62209 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.2 ms