Protein–RNA interactions for Protein: Q61510

Trim25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim25Q61510 2610507B11Rik-201ENSMUST00000010421 7443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Kifc3-202ENSMUST00000169353 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Srrm1-202ENSMUST00000084846 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Trim25Q61510 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Zc3h7b-201ENSMUST00000109554 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gm13055-201ENSMUST00000127875 1961 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 4930556M19Rik-201ENSMUST00000180604 2468 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Sp6-202ENSMUST00000107622 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Prrxl1-202ENSMUST00000186452 2371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Fam198a-204ENSMUST00000215990 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 1600002D24Rik-202ENSMUST00000136744 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Srsf10-205ENSMUST00000126641 3754 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Rwdd4a-201ENSMUST00000033973 2921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Mfsd4a-205ENSMUST00000144548 3288 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Opa3-201ENSMUST00000063976 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Wdr5-201ENSMUST00000113952 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Btrc-201ENSMUST00000065601 2978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Trpm4-201ENSMUST00000042194 4234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Cyp1b1-201ENSMUST00000024894 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Bhmt-201ENSMUST00000099309 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Naa40-201ENSMUST00000025675 3275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Pja1-202ENSMUST00000113790 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Shmt2-206ENSMUST00000219239 2238 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Ilvbl-203ENSMUST00000218215 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Idh3b-201ENSMUST00000028892 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Kmt5c-203ENSMUST00000108583 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Csk-209ENSMUST00000217314 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Kansl3-205ENSMUST00000186470 2801 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Rtl6-201ENSMUST00000069476 4426 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Arnt-201ENSMUST00000015666 2603 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Hnrnpul1-201ENSMUST00000043765 3354 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Klf12-201ENSMUST00000097079 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Emc7-201ENSMUST00000069747 5826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Ptger3-201ENSMUST00000041175 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gm17029-202ENSMUST00000146124 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Wdr54-205ENSMUST00000153148 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Nat8f6-202ENSMUST00000174143 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Gm37644-201ENSMUST00000192190 2270 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Adcyap1r1-202ENSMUST00000070756 6107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Trim25Q61510 Mterf4-202ENSMUST00000112942 1525 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms