Protein–RNA interactions for Protein: Q61481

Pde1a, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1A, mousemouse

Predictions only

Length 565 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde1aQ61481 Clnkos-201ENSMUST00000114080 439 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ccnh-202ENSMUST00000163600 1055 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm18766-201ENSMUST00000189811 808 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm6888-201ENSMUST00000221983 706 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Dpp7-201ENSMUST00000028332 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Mtmr7-202ENSMUST00000048898 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Tmem176b-203ENSMUST00000166247 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Chfr-207ENSMUST00000198633 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Kirrel-203ENSMUST00000159976 7236 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ece2-201ENSMUST00000003898 3152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Eftud2-202ENSMUST00000107060 3339 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 5033426O07Rik-202ENSMUST00000212635 2110 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gnl3-201ENSMUST00000037739 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Sumo3-202ENSMUST00000099538 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Mrto4-202ENSMUST00000102503 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Ly6g6e-204ENSMUST00000172959 501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm20661-203ENSMUST00000177368 900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm29541-201ENSMUST00000191351 678 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gmpr2-201ENSMUST00000002397 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Sh3bp5-201ENSMUST00000091903 2684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Pcp2-202ENSMUST00000128566 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Phka1-204ENSMUST00000119229 6025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Inhba-201ENSMUST00000042603 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gli1-201ENSMUST00000026474 4057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Bbs7-203ENSMUST00000108156 2687 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Caprin2-201ENSMUST00000072324 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Spred2-202ENSMUST00000093299 4449 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Tcf21-202ENSMUST00000218002 1788 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm13383-201ENSMUST00000131190 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm42854-201ENSMUST00000201262 722 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm9182-201ENSMUST00000217829 639 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gm6566-201ENSMUST00000221468 1171 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Golt1b-201ENSMUST00000032372 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Tubb3-201ENSMUST00000071134 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Gckr-201ENSMUST00000072228 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Chd1-202ENSMUST00000024627 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Pde1aQ61481 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde1aQ61481 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde1aQ61481 Gm21009-201ENSMUST00000197169 1669 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde1aQ61481 Kcnj8-201ENSMUST00000032374 2269 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde1aQ61481 Tmem241-202ENSMUST00000055447 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde1aQ61481 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Pde1aQ61481 Cep63-201ENSMUST00000093791 2696 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1aQ61481 Cntfr-204ENSMUST00000102962 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Pde1aQ61481 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 101.5 ms