Protein–RNA interactions for Protein: Q60972

Rbbp4, Histone-binding protein RBBP4, mousemouse

Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp4Q60972 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Camk2b-208ENSMUST00000109812 1875 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Eif4a3-201ENSMUST00000026667 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gbe1-207ENSMUST00000171132 3303 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Wls-205ENSMUST00000198878 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Dnase1l1-201ENSMUST00000019232 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Ywhag-205ENSMUST00000198270 1610 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Hsph1-211ENSMUST00000202361 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 F2r-201ENSMUST00000059193 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Rbbp4Q60972 Pde4d-203ENSMUST00000117420 1955 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Vps26b-201ENSMUST00000034470 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Wwox-202ENSMUST00000109107 2383 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Etfdh-201ENSMUST00000029386 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Sphk2-201ENSMUST00000072836 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 P4ha2-201ENSMUST00000019050 2230 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Commd7-201ENSMUST00000071852 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Itpripl1-203ENSMUST00000154021 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Iah1-204ENSMUST00000223345 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Haus5-201ENSMUST00000019697 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 P4ha2-202ENSMUST00000093107 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Map7d1-201ENSMUST00000061143 3351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Sh3glb1-201ENSMUST00000163279 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Brpf1-210ENSMUST00000204626 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Actr1b-201ENSMUST00000043951 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Kctd14-206ENSMUST00000206658 2339 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Hoxa7-201ENSMUST00000048715 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm20465-201ENSMUST00000174768 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Mpl-201ENSMUST00000006556 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Specc1-202ENSMUST00000092415 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Il9r-202ENSMUST00000128311 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Miat-205ENSMUST00000182953 9163 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Nfasc-201ENSMUST00000043189 5072 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Gm17613-201ENSMUST00000138893 669 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Tmem38a-201ENSMUST00000034244 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Vwa2-201ENSMUST00000026068 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Olfr683-202ENSMUST00000209879 3841 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Ncdn-202ENSMUST00000106116 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Phgdh-201ENSMUST00000065793 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Tmem164-202ENSMUST00000101198 4443 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Spns1-201ENSMUST00000032994 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Repin1-204ENSMUST00000135151 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Mroh1-202ENSMUST00000096385 5268 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Rbbp4Q60972 4632428C04Rik-201ENSMUST00000181485 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms