Protein–RNA interactions for Protein: Q60934

Grik1, Glutamate receptor ionotropic, kainate 1, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik1Q60934 Gm29667-201ENSMUST00000190817 490 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Dupd1-202ENSMUST00000224735 548 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Capg-203ENSMUST00000114072 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Art3-205ENSMUST00000120193 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 4930425O10Rik-201ENSMUST00000197761 1418 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Krt42-201ENSMUST00000017270 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Entpd5-204ENSMUST00000117286 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Ydjc-202ENSMUST00000115702 1713 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gatm-201ENSMUST00000028624 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Grik1Q60934 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Tc2n-203ENSMUST00000160830 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Dgkq-201ENSMUST00000053913 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Jakmip3-201ENSMUST00000106111 1571 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Aurkc-204ENSMUST00000208049 1401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gm15653-201ENSMUST00000119247 907 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gm12212-201ENSMUST00000141032 378 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Il11-202ENSMUST00000163481 990 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gm4691-201ENSMUST00000182339 1000 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gm2451-201ENSMUST00000199447 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gm10290-201ENSMUST00000200451 999 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gata4-201ENSMUST00000067417 3400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Fam219b-201ENSMUST00000093833 3001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Adamts2-201ENSMUST00000040523 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Grik1Q60934 Trmt10c-201ENSMUST00000059052 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 5730559C18Rik-201ENSMUST00000120339 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Mocos-201ENSMUST00000068006 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Dnajc22-201ENSMUST00000061295 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Apol8-202ENSMUST00000089450 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Zdhhc7-201ENSMUST00000034280 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Icam4-201ENSMUST00000001040 971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Kif16bos-201ENSMUST00000124774 495 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gm27631-201ENSMUST00000184163 466 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 AL593843.1-201ENSMUST00000195891 145 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gm36236-201ENSMUST00000220780 701 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Tubg2-201ENSMUST00000043654 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Usp42-201ENSMUST00000053287 5151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Slc9a3r2-202ENSMUST00000019684 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Grik1Q60934 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik1Q60934 Slc25a47-201ENSMUST00000057026 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik1Q60934 Sec24a-202ENSMUST00000064297 2104 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik1Q60934 Slc6a8-203ENSMUST00000114465 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Grik1Q60934 Dnm1-205ENSMUST00000113365 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
Grik1Q60934 Lats2-210ENSMUST00000174694 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms