Protein–RNA interactions for Protein: Q60932

Vdac1, Voltage-dependent anion-selective channel protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 296 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vdac1Q60932 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Hsd17b11-202ENSMUST00000119025 2234 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Sf3a2-203ENSMUST00000148665 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Lrrc17-201ENSMUST00000035651 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Zscan12-202ENSMUST00000099720 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Prrx1-204ENSMUST00000174397 6527 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Fam234a-201ENSMUST00000114988 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.69□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Traf2-201ENSMUST00000028311 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Lhx1-201ENSMUST00000018842 3846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Enpp1-203ENSMUST00000135846 2721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Zbtb45-202ENSMUST00000172240 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Cbs-202ENSMUST00000078509 2403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Asic3-201ENSMUST00000049346 1853 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Kcnq2-202ENSMUST00000049792 2920 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gm30238-201ENSMUST00000195528 2603 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gpr137-205ENSMUST00000166115 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Rgs16-201ENSMUST00000027748 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gm14042-201ENSMUST00000120139 833 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gm9726-201ENSMUST00000180321 678 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 2010010A06Rik-203ENSMUST00000190465 650 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Vkorc1-201ENSMUST00000033074 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Taz-202ENSMUST00000114180 1786 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 P2ry2-201ENSMUST00000037540 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Rab37-201ENSMUST00000021076 2210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Ankra2-208ENSMUST00000226100 1476 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Tnpo2-201ENSMUST00000093360 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Syngr1-201ENSMUST00000009727 4180 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Opa1-201ENSMUST00000038867 3230 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 AC121805.2-201ENSMUST00000218808 2538 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gm26559-201ENSMUST00000181939 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Rad9a-201ENSMUST00000025740 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Pnkd-201ENSMUST00000027370 2937 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Tmem86b-202ENSMUST00000205360 1344 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Dnm1-203ENSMUST00000113350 3258 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Heatr3-201ENSMUST00000034079 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gm14168-201ENSMUST00000144818 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Arl6ip1-201ENSMUST00000032888 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Irs1-201ENSMUST00000069799 9144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Flt3-201ENSMUST00000049324 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Hdac8-201ENSMUST00000087916 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Epb41-208ENSMUST00000105981 5303 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Rarg-201ENSMUST00000043172 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Ankrd34b-203ENSMUST00000168871 3397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Narfl-204ENSMUST00000134108 2062 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Atp2a3-202ENSMUST00000108484 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Setd1b-206ENSMUST00000174836 7515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Pfkfb3-203ENSMUST00000100411 2008 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Zfp146-201ENSMUST00000062181 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Foxj2-202ENSMUST00000177927 4620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Ptpn11-202ENSMUST00000100770 5599 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Pfkfb3-205ENSMUST00000114845 1971 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 P2rx3-202ENSMUST00000111613 1764 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 Gpc2-201ENSMUST00000014089 2514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Vdac1Q60932 A3galt2-202ENSMUST00000106077 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.8 ms